Variantes genéticas recesivas asociadas a abortos y mortalidad de terneros en ganado lechero : estudio sobre su presencia e impacto en el desempeño reproductivo y productivo de vacas holando de Uruguay

Los experimentos I y II de la presente tesis consistieron en la optimización de las técnicas PCR-HRM/melting en tiempo real para la detección de la malformación vertebral compleja (CVM, OMIA 001340-9913) y la deficiencia de colesterol (CD, OMIA 001965-9913), así como para determinar su existencia en la muestra representativa de vacas Holando (n = 279 para CVM; n = 103 para CD) de Uruguay. Las amplificaciones de los productos PCR de 79 pb de CVM y de 170 y 146 pb de CD permitieron diferenciar claramente los dos genotipos. Se encontró que la prevalencia de CVM (6,45 %) fue alta. El inserto mutante BoERVK asociado con CD no fue detectado. El experimento III consistió en: (a) identificar toros (n = 3028) con información genética para haplotipos relacionados con problemas de fertilidad que causan abortos y mortalidad de terneros en ganado lechero (HH1, OMIA 000001-9913; HH3, OMIA 001824-9913; y HH4, OMIA 001826- 9913) mediante análisis del catálogo de padres Holando 2021; y (b) determinar la presencia de estos haplotipos mencionados, JH1 (OMIA 001697-9913) y CVM con el chip bovino GeneTitan®, estimar sus frecuencias y evaluar su impacto en la fertilidad de las vacas Holando y cruzas Holando con Jersey (n = 170) pertenecientes a un tambo experimental. De un total de 1468 toros con información genética para HH1 y de 1471 para HH3 y HH4, se encontraron 90 portadores para HH1, 60 para HH3 y 6 para HH4, respectivamente. Mediante genotipado con el chip se determinaron las prevalencias para HH1 y CVM que fueron de 0,59 y 4,3 % (call rate > 0,99), respectivamente. No se encontraron alelos mutantes para HH3, HH4 y JH1. Se evaluaron los datos reproductivos y se observó la presencia de los alelos mutantes de CVM y HH1 en vacas repetidoras, que parieron terneros muertos, con un promedio de 4 repeticiones del servicio para lograr la preñez

IDENTIFICATION OF HOLSTEIN COWS CARRIERS OF COMPLEX VERTEBRAL MALFORMATION BY HIGH RESOLUTION MELTING CURVES (HRM)

The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene™ 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q = 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs

HIGH- RESOLUTION MELTING (HRM) CURVE ANALYSIS: NEW APPROACH USED TO DETECT BLAD AND DUMPS IN URUGUAYAN HOLSTEIN BREED

The widespread use of artificial insemination has allowed the expansion of genetic progress. However, it also brought consequences such as the expansion of lethal hereditary diseases and the increase in inbreeding. The object of this study was to establish a fast and sensitive molecular assay to detect bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) and deficiency of uridine monophosphate synthase (DUMPS) carriers in Uruguayan Holstein cattle by means of high resolution melting (HRM) curve analysis. By testing previously confirmed carrier and non-carrier animals, we set up a rapid, simple, and inexpensive diagnostic test using PCR followed by HRM curve analysis. The PCR-HRM genotyping method was effective for the discrimination of BLAD and DUMPS homozygous genotypes, and the BLAD heterozygous genotype. We conclude that the PCR-HRM assay is a robust, reliable, and economical tool for the detection of these mutations in the Holstein breed, which may be implemented in genetic selection programs

Einfluss von drei Einzelnucleotidpolymorphismen im CAPN1 Gen auf die Zartheit von Rindfleisch

Meat tenderness is an important trait in beef cattle production, as consumers consider tenderness the most important attribute of beef palatability. There is ample evidence that post mortem proteolysis of myofibrillar proteins is responsible for the decline in shear force uring storage. The bovine micromolar calcium-activated neutral protease CAPN1) gene encodes the large subunit of μ-calpain, which is thought to be one of the most important enzymes involved in post mortem tenderization (KOOHMARAIE 1996). Three single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on the CAPN1 gene (316, 530 and 4 751 markers)have been associated with tenderness in different cattle breeds (PAGE et al. 2002, PAGE et al. 2004, WHITE et al. 2005). A more recent study confirmed that markers 316 and 4 751 had an effect on beef tenderness (VAN EENENNAAM et al. 2007). The objective of this research was to determine the existence of polymorphisms and to assess the effect of the reported SNP in the bovine CAPN1 gene on tenderness from a sample of Angus and Brangus steers fattened on pasture.Fil: Soria, Liliana A.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: Corva, Pablo Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Sica, Andrea Branda. Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria; UruguayFil: Schor, Alejandro. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomia. Departamento de Producción Animal. Cátedra de Bovinos de Carne; ArgentinaFil: Melucci, Lilia Magdalena. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Villarreal, Edgardo L.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Área de Investigación en Producción y Sanidad Animal; ArgentinaFil: Mezzadra, Carlos Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Área de Investigación en Producción y Sanidad Animal; ArgentinaFil: Cantet, Rodolfo Juan Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario; ArgentinaFil: Miquel, Maria Cristina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentin